這套研究最早是由德國的H.W.Dove在1839發現的，所以雙耳波差的相關研究與臨床已經有已經有165年的歷史，而目前具有完整的實證與實驗數據以及應用品就屬蒙羅機構的最完整。

要說明雙耳波差前，我們先對我們大腦對音頻輸入的結構談起。不論任何聲音都是經由兩個耳朵進入，在經由腦幹上方的左右橄欖體接收頻率，左右兩邊橄欖體接受頻率，左右橄欖體接收處理後，將共振的頻波傳送到RAS系統，經由RAS系統接受雙腦同步的雙耳波差共振波，藉此改善複雜的意識。

在客觀上，腦波測量的研究提供了「雙腦同步」在意識上影響很好的證據。因為RAS可調節皮質上的腦波值。如果我們長期追蹤腦波測量的「網狀活性系統」RAS。就可以得到一些答案了。在1995年Owens and Atwater兩學者研究發現，如果人類在δ波及θ波的雙腦同步刺激期間，人類減少產生重要的α波及β波，而θ及δ波增加。這些研究文件證明「網狀活性系統」RAS 暴露在雙腦同步時可測量出明顯的改變。

美國腦波研究機構對雙耳波差圖解原理說明：